Efter ni års adskillelse er de to afghanske flygtningebrødre Popal (21) og Darmal (18) blevet genforenet i Danmark. Men de to brødre står vidt forskellige steder i livet. Popal har for længst fået asyl i Danmark og er en fighter med masser af drømme for fremtiden. Darmal derimod er ny i landet, tung om hjertet og usikker på sin fremtid. Da Darmal får afslag på asyl, smuldrer brødrenes drøm om en fælles fremtid. Med et kærligt præstepar og en engageret menneskerettighedsadvokat som nærmeste allierede er Min bror, mit hjem en film om en storebrors kamp for ikke at miste sin lillebror igen.